スタンドアローン・イシュー（Stand Alone Issue）とは、M&Aにおいて対象会社・事業が既存の親会社・企業グループから離脱し、単独での事業運営を必要とされる場合に発生する問題をいう。

具体的なイシューはケース・バイ・ケースであるが、一般的にはビジネス面（共同開発、購買、営業、物流など）、設備（オフィス、工場・生産設備など）、特許・商標・ライセンス、ファイナンス（財務・経理・保険など）、ITシステム、人事制度（年金、退職金、福利厚生など）など、多岐に亘る。

スタンドアローン・イシューは、買収後の対象会社・事業の運営に関わる重要な要素であり、買い手は取引の初期段階より対応方針の検討を進め、デュー・ディリジェンスを通じてイシューを明確化する必要がある。また、スタンドアローン・イシューに対する手当てとして、取引後一定期間売り手によるサポートを約束するTSA（Transition Service Agreement）を締結するケースもある。